Le Campione, ou Godslayer, possède des pouvoirs lui permettant de tuer un être céleste, ou même un Dieu. Il est en mesure de s'imposer parmi les mortels, de les dominer. En cela, il peut représenter le chef suprême, tout comme il peut constituer une menace.
Godou Kusanagi, 16 ans, est un lycéen qui s'est vu contraint d'abandonner le baseball suite à une blessure. Lors des vacances de printemps, sa vie sera bouleversée. En effet, certaines circonstances l'ont amené à tuer une divinité, Verethragna. C'est de cette manière que le jeune homme va malgré lui devenir le septième Campione, le plus jeune à ce jour. Il doit alors prendre ses responsabilités et lutter contre les différents problèmes causés par les Dieux…
