Alors qu'elle poursuit un fugitif extraterrestre, Birdy Cephon Altera, une policière de la Fédération spatiale, se retrouve sur Terre. Birdy a retrouvé Geega, le criminel dans un bâtiment abandonné. Lors du combat entre les deux extraterrestres, Tsutomu Senkawa, un lycéen moyen qui explorait le batiment, est tué accidentellement par Birdy. Elle décide rapidement de le sauver en intégrant sa conscience dans le corps de Tsutomu. Désormais, Birdy et Senkawa doivent non seulement cohabiter dans le même corps, mais aussi trouver un équilibre entre la vie de Senkawa au lycée et le travail de plus en plus dangereux de Birdy.
